| 1 | 58 | University of Tokyo / 東京大学 |  | 58 | 87 | 336 | 40 |
| 2 | 101 | Kyoto University / 京都大学 | | 216 | 144 | 214 | 86 |
| 3 | 172 | Osaka University / 大阪大学 | | 133 | 301 | 160 | 144 |
| 4 | 210 | Tohoku University / 東北大学 | | 95 | 380 | 335 | 161 |
| 5 | 244 | Nagoya University / 名古屋大学 | | 777 | 360 | 179 | 227 |
| 6 | 292 | Kyushu University / 九州大学 | | 442 | 404 | 383 | 242 |
| 7 | 301 | Tokyo Institute of Technology / 東京工業大学 | | 329 | 480 | 95 | 285 |
| 8 | 305 | Hokkaido University / 北海道大学 | | 370 | 368 | 366 | 314 |
| 9 | 310 | Keio University / 慶応義塾大学 | | 359 | 220 | 637 | 400 |
| 10 | 337 | University of Tsukuba / 筑波大学 | | 504 | 346 | 470 | 364 |
| 11 | 442 | Hiroshima University / 広島大学 | | 418 | 539 | 711 | 482 |
| 12 | 460 | Waseda University / 早稲田大学 | | 689 | 559 | 552 | 517 |
| 13 | 461 | Kobe University / 神戸大学 | | 686 | 612 | 650 | 469 |
| 14 | 635 | Okayama University / 岡山大学 | | 892 | 1194 | 556 | 545 |
| 15 | 699 | Ritsumeikan University / 立命館大学 | | 787 | 531 | 1238 | 956 |
| 16 | 747 | Chiba University / 千葉大学 | | 3141 | 1232 | 1783 | 550 |
| 17 | 785 | Kanazawa University / 金沢大学 | | 1477 | 1313 | 781 | 740 |
| 18 | 795 | Shinshu University / 信州大学 | | 1313 | 1476 | 828 | 696 |
| 19 | 816 | Nihon University / 日本大学 | | 1034 | 896 | 1138 | 991 |
| 20 | 825 | (1) Tokyo University of Science / 東京理科大学 | | 1926 | 1347 | 673 | 840 |
| 21 | 842 | Kumamoto University / 熊本大学 | | 1513 | 1475 | 940 | 781 |
| 22 | 854 | Niigata University / 新潟大学 | | 1219 | 1400 | 782 | 859 |
| 23 | 895 | Tokyo Medical and Dental University / 東京医科歯科大学 | | 2953 | 2052 | 635 | 717 |
| 24 | 915 | Nagasaki University / 長崎大学 | | 1462 | 1390 | 1065 | 921 |
| 25 | 917 | Kindai University (Kinki University) / 近畿大学 | | 1890 | 1610 | 773 | 891 |
| 26 | 928 | Tokyo Metropolitan University / 首都大学東京 | | 2850 | 2177 | 429 | 792 |
| 27 | 1011 | Osaka City University / 大阪市立大学 | | 1572 | 1660 | 1242 | 953 |
| 28 | 1012 | Yamagata University / 山形大学 | | 1456 | 1316 | 1591 | 1068 |
| 29 | 1025 | Tokai University / 東海大学 | | 2093 | 1307 | 2086 | 1015 |
| 30 | 1040 | Tokyo University of Agriculture and Technology / 東京農工大学 | | 2683 | 1855 | 633 | 1035 |
| 31 | 1046 | Gifu University / 岐阜大学 | | 1267 | 1674 | 1007 | 1081 |
| 32 | 1059 | Ehime University / 愛媛大学 | | 1825 | 1611 | 1122 | 1096 |
| 33 | 1071 | Gunma University / 群馬大学 | | 1912 | 1414 | 1508 | 1131 |
| 34 | 1077 | Mie University / 三重大学 | | 1582 | 1379 | 1264 | 1233 |
| 35 | 1079 | Kagoshima University / 鹿児島大学 | | 1454 | 1574 | 1769 | 1055 |
| 36 | 1081 | Yamaguchi University / 山口大学 | | 1351 | 1368 | 1909 | 1149 |
| 37 | 1083 | University of Tokushima / 徳島大学 | | 1838 | 2010 | 915 | 1028 |
| 38 | 1107 | University of Toyama / 富山大学 | | 1910 | 1807 | 863 | 1136 |
| 39 | 1119 | Osaka Prefecture University / 大阪府立大学 | | 1302 | 1962 | 953 | 1111 |
| 40 | 1147 | Shizuoka University / 静岡大学 | | 1740 | 1961 | 1089 | 1113 |
| 41 | 1150 | Nara Institute of Science & Technology / 奈良先端科学技術大学院大学 | | 1388 | 2045 | 652 | 1210 |
| 42 | 1153 | Japan Advanced Institute of Science & Technology / 北陸先端科学技術大学院大学 | | 2082 | 995 | 1106 | 1660 |
| 43 | 1157 | Juntendo University / 順天堂大学 | | 3567 | 3012 | 655 | 886 |
| 44 | 1168 | University of Electro-Communications / 電気通信大学 | | 1717 | 1376 | 1605 | 1343 |
| 45 | 1185 | Yokohama City University / 横浜市立大学 | | 3810 | 2932 | 1059 | 871 |
| 46 | 1186 | Yokohama National University / 横浜国立大学 | | 2349 | 1721 | 697 | 1375 |
| 47 | 1193 | Tokyo Women's Medical University / 東京女子医科大学 | | 5002 | 2549 | 1043 | 949 |
| 48 | 1212 | United Nations University (国際連合大学) | | 1113 | 339 | 979 | 2809 |
| 49 | 1242 | Doshisha University / 同志社大学 | | 1136 | 1234 | 794 | 1812 |
| 50 | 1246 | Meiji University / 明治大学 | | 1421 | 1003 | 1397 | 1833 |
| 51 | 1264 | Toho University / 東邦大学 | | 3077 | 1986 | 1724 | 1190 |
| 52 | 1264 | Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学 | | 2403 | 1800 | 1178 | 1381 |
| 53 | 1293 | Saga University / 佐賀大学 | | 2188 | 2018 | 1486 | 1290 |
| 54 | 1297 | Kitasato University / 北里大学 | | 3360 | 2328 | 1651 | 1113 |
| 55 | 1298 | Nagoya Institute of Technology / 名古屋工業大学 | | 2445 | 1939 | 1129 | 1384 |
| 56 | 1325 | Fukuoka University / 福岡大学 | | 2525 | 1857 | 1468 | 1406 |
| 57 | 1332 | University of Ryukyus / 琉球大学 | | 1148 | 1703 | 1509 | 1528 |
| 58 | 1346 | University of Yamanashi / 山梨大学 | | 2782 | 2423 | 1056 | 1298 |
| 59 | 1360 | Hosei University / 法政大学 | | 640 | 1129 | 1624 | 1980 |
| 60 | 1374 | Saitama University / 埼玉大学 | | 2837 | 1996 | 1092 | 1496 |
| 61 | 1407 | Kagawa University / 香川大学 | | 1920 | 2629 | 1487 | 1318 |
| 62 | 1432 | Hirosaki University / 弘前大学 | | 2084 | 2066 | 1823 | 1457 |
| 63 | 1441 | Kochi University / 高知大学 | | 2777 | 2408 | 2426 | 1272 |
| 64 | 1473 | Jichi Medical School / 自治医科大学 | | 4056 | 3813 | 1118 | 1087 |
| 65 | 1475 | Nippon Medical School / 日本医科大学 | | 6408 | 3227 | 1102 | 1213 |
| 66 | 1484 | Kansai University / 関西大学 | | 1267 | 1671 | 1247 | 1930 |
| 67 | 1491 | Tottori University / 鳥取大学 | | 1113 | 2676 | 1840 | 1411 |
| 68 | 1510 | Nagaoka University of Technology / 長岡技術科学大学 | | 2150 | 1954 | 1163 | 1812 |
| 69 | 1511 | Ochanomizu University / お茶の水女子大学 | | 2084 | 2518 | 1577 | 1492 |
| 70 | 1521 | Chuo University / 中央大学 | | 1443 | 1487 | 2069 | 1944 |
| 71 | 1533 | Nagoya City University / 名古屋市立大学 | | 3980 | 3360 | 1187 | 1302 |
| 72 | 1537 | Teikyo University / 帝京大学 | | 4410 | 2935 | 3443 | 1118 |
| 73 | 1540 | Tokyo Medical University / 東京医科大学 | | 3021 | 3394 | 2057 | 1192 |
| 74 | 1561 | Shimane University / 島根大学 | | 1771 | 2816 | 1559 | 1505 |
| 75 | 1584 | University of Miyazaki / 宮崎大学 | | 2767 | 2614 | 1454 | 1618 |
| 76 | 1597 | Okinawa Institute of Science & Technology Graduate University / 沖縄科学技術大学院大学 | | 3192 | 2855 | 960 | 1653 |
| 77 | 1629 | Rikkyo University / 立教大学 | | 2145 | 1808 | 2464 | 1911 |
| 78 | 1652 | Fujita Health University / 藤田保健衛生大学 | | 4730 | 3753 | 1075 | 1412 |
| 79 | 1652 | Jikei University School of Medicine / 東京慈恵会医科大学 | | 6168 | 4026 | 1575 | 1230 |
| 80 | 1665 | Toyohashi University of Technology / 豊橋科学技術大学 | | 3208 | 2172 | 1794 | 1854 |
| 81 | 1678 | University of Fukui / 福井大学 | | 3055 | 3389 | 1183 | 1563 |
| 82 | 1685 | Showa University / 昭和大学 | | 4555 | 3420 | 2192 | 1370 |
| 83 | 1693 | (1) Hiroshima Institute of Technology / 広島工業大学 | | 5342 | 2461 | 5903 | 1230 |
| 84 | 1697 | University of Aizu / 会津大学 | | 4115 | 2586 | 1674 | 1752 |
| 85 | 1697 | Hamamatsu University School of Medicine / 浜松医科大学 | | 5535 | 3817 | 817 | 1501 |
| 86 | 1718 | Sophia University / 上智大学 | | 3005 | 1670 | 1652 | 2264 |
| 87 | 1720 | Kyoto Prefectural University of Medicine / 京都府立医科大学 | | 5774 | 4303 | 1916 | 1210 |
| 88 | 1735 | The Graduate University for Advanced Studies / 総合研究大学院大学 | | 4960 | 6010 | 1355 | 997 |
| 89 | 1736 | Aoyama Gakuin University / 青山学院大学 | | 3175 | 1879 | 1985 | 2123 |
| 90 | 1751 | Kurume University / 久留米大学 | | 5560 | 4033 | 2119 | 1336 |
| 91 | 1751 | Kwansei Gakuin University / 関西学院大学 | | 915 | 2146 | 1780 | 2173 |
| 92 | 1755 | Sapporo Medical University / 札幌医科大学 | | 4948 | 3551 | 3342 | 1333 |
| 93 | 1777 | Iwate University / 岩手大学 | | 2837 | 2218 | 2355 | 2014 |
| 94 | 1777 | University of Hyogo (Himeji Institute of Technology) / 兵庫県立大学 | | 3916 | 3874 | 1051 | 1633 |
| 95 | 1792 | Akita University / 秋田大学 | | 2845 | 2782 | 2217 | 1839 |
| 96 | 1798 | Chubu University / 中部大学 | | 3273 | 3184 | 846 | 1971 |
| 97 | 1801 | Kyoto Sangyo University / 京都産業大学 | | 2853 | 2182 | 1713 | 2162 |
| 98 | 1811 | Kyoto Institute of Technology / 京都工芸繊維大学 | | 3421 | 2847 | 1815 | 1879 |
| 99 | 1838 | Ibaraki University / 茨城大学 | | 2546 | 2882 | 1934 | 1937 |
| 100 | 1861 | Shiga University of Medical Science / 滋賀医科大学 | | 4730 | 3909 | 2558 | 1510 |
