| 1 | 48 | University of Tokyo / 東京大学 |  | 94 | 79 | 143 | 27 |
| 2 | 82 | Kyoto University / 京都大学 | | 88 | 131 | 132 | 77 |
| 3 | 165 | Osaka University / 大阪大学 | | 270 | 306 | 242 | 113 |
| 4 | 214 | Tohoku University / 東北大学 | | 372 | 392 | 383 | 121 |
| 5 | 227 | Nagoya University / 名古屋大学 | | 315 | 326 | 325 | 196 |
| 6 | 263 | Hokkaido University / 北海道大学 | | 273 | 356 | 429 | 264 |
| 7 | 265 | Kyushu University / 九州大学 | | 436 | 385 | 384 | 246 |
| 8 | 277 | Keio University / 慶応義塾大学 | | 429 | 204 | 657 | 388 |
| 9 | 286 | Tokyo Institute of Technology / 東京工業大学 | | 550 | 450 | 280 | 245 |
| 10 | 324 | University of Tsukuba / 筑波大学 | | 410 | 344 | 744 | 341 |
| 11 | 376 | Hiroshima University / 広島大学 | | 403 | 509 | 512 | 407 |
| 12 | 438 | Kobe University / 神戸大学 | | 555 | 589 | 712 | 476 |
| 13 | 472 | Waseda University / 早稲田大学 | | 1801 | 582 | 552 | 485 |
| 14 | 575 | Okayama University / 岡山大学 | | 419 | 1292 | 582 | 497 |
| 15 | 624 | Ritsumeikan University / 立命館大学 | | 1155 | 480 | 1054 | 906 |
| 16 | 666 | Chiba University / 千葉大学 | | 3123 | 1366 | 441 | 523 |
| 17 | 685 | Kanazawa University / 金沢大学 | | 739 | 1201 | 1025 | 643 |
| 18 | 749 | (1) Tokyo University of Science / 東京理科大学 | | 2269 | 1233 | 700 | 753 |
| 19 | 760 | Kumamoto University / 熊本大学 | | 1191 | 1423 | 900 | 731 |
| 20 | 770 | Niigata University / 新潟大学 | | 962 | 1422 | 743 | 798 |
| 21 | 773 | Nihon University / 日本大学 | | 1136 | 893 | 1460 | 898 |
| 22 | 819 | Shinshu University / 信州大学 | | 1903 | 1616 | 1006 | 688 |
| 23 | 839 | Nagasaki University / 長崎大学 | | 1104 | 1332 | 1160 | 890 |
| 24 | 864 | Tokyo Metropolitan University / 首都大学東京 | | 3656 | 1824 | 377 | 793 |
| 25 | 865 | Tokyo Medical and Dental University / 東京医科歯科大学 | | 3677 | 1976 | 707 | 662 |
| 26 | 871 | Japan Advanced Institute of Science & Technology / 北陸先端科学技術大学院大学 | | 1149 | 796 | 1065 | 1386 |
| 27 | 882 | Yamagata University / 山形大学 | | 717 | 1275 | 1559 | 995 |
| 28 | 911 | Gunma University / 群馬大学 | | 1627 | 1279 | 1311 | 990 |
| 29 | 916 | Gifu University / 岐阜大学 | | 510 | 1769 | 1142 | 964 |
| 30 | 949 | Osaka City University / 大阪市立大学 | | 1602 | 1855 | 1305 | 837 |
| 31 | 949 | Kagoshima University / 鹿児島大学 | | 1237 | 1327 | 1570 | 1029 |
| 32 | 959 | Osaka Prefecture University / 大阪府立大学 | | 2174 | 1642 | 1014 | 938 |
| 33 | 970 | Kindai University (Kinki University) / 近畿大学 | | 1834 | 1888 | 1527 | 800 |
| 34 | 975 | Nara Institute of Science & Technology / 奈良先端科学技術大学院大学 | | 777 | 2016 | 644 | 1048 |
| 35 | 984 | Tokai University / 東海大学 | | 2212 | 1400 | 1748 | 950 |
| 36 | 989 | University of Toyama / 富山大学 | | 1516 | 1780 | 866 | 1012 |
| 37 | 991 | University of Electro-Communications / 電気通信大学 | | 2470 | 1453 | 1047 | 1053 |
| 38 | 1015 | Tokyo University of Agriculture and Technology / 東京農工大学 | | 2920 | 1742 | 991 | 960 |
| 39 | 1019 | United Nations University (国際連合大学) | | 995 | 342 | 834 | 2584 |
| 40 | 1031 | Mie University / 三重大学 | | 1344 | 1524 | 1168 | 1162 |
| 41 | 1041 | Nagoya Institute of Technology / 名古屋工業大学 | | 2384 | 1494 | 962 | 1153 |
| 42 | 1042 | University of Tokushima / 徳島大学 | | 1529 | 2150 | 1055 | 925 |
| 43 | 1048 | Ehime University / 愛媛大学 | | 2323 | 1660 | 1513 | 957 |
| 44 | 1065 | Doshisha University / 同志社大学 | | 791 | 1317 | 1015 | 1497 |
| 45 | 1114 | Saga University / 佐賀大学 | | 1713 | 1541 | 1796 | 1166 |
| 46 | 1120 | Meiji University / 明治大学 | | 836 | 1115 | 1272 | 1695 |
| 47 | 1138 | Yokohama National University / 横浜国立大学 | | 2280 | 1947 | 796 | 1217 |
| 48 | 1168 | Tokyo Women's Medical University / 東京女子医科大学 | | 2204 | 2900 | 914 | 878 |
| 49 | 1174 | Yamaguchi University / 山口大学 | | 1145 | 2077 | 1676 | 1111 |
| 50 | 1178 | Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学 | | 1462 | 1912 | 980 | 1339 |
| 51 | 1190 | Shizuoka University / 静岡大学 | | 1972 | 2154 | 1069 | 1170 |
| 52 | 1227 | University of Ryukyus / 琉球大学 | | 1259 | 1809 | 1579 | 1358 |
| 53 | 1236 | Kitasato University / 北里大学 | | 2584 | 2086 | 1962 | 1038 |
| 54 | 1244 | University of Yamanashi / 山梨大学 | | 2793 | 2563 | 827 | 1119 |
| 55 | 1255 | Nagaoka University of Technology / 長岡技術科学大学 | | 636 | 1859 | 1283 | 1580 |
| 56 | 1295 | Hirosaki University / 弘前大学 | | 1450 | 1722 | 1984 | 1431 |
| 57 | 1301 | Hosei University / 法政大学 | | 1099 | 1152 | 1800 | 1934 |
| 58 | 1305 | Fukuoka University / 福岡大学 | | 2013 | 2064 | 1820 | 1296 |
| 59 | 1326 | Yokohama City University / 横浜市立大学 | | 2412 | 3335 | 1375 | 938 |
| 60 | 1340 | Juntendo University / 順天堂大学 | | 5770 | 3597 | 1024 | 827 |
| 61 | 1348 | University of Miyazaki / 宮崎大学 | | 2611 | 1980 | 1326 | 1501 |
| 62 | 1358 | Saitama University / 埼玉大学 | | 2684 | 2357 | 1112 | 1392 |
| 63 | 1362 | Kochi University / 高知大学 | | 2611 | 2543 | 2384 | 1066 |
| 64 | 1363 | (1) Hiroshima Institute of Technology / 広島工業大学 | | 2854 | 1145 | 4758 | 1390 |
| 65 | 1383 | Kansai University / 関西大学 | | 1657 | 1982 | 1498 | 1625 |
| 66 | 1398 | Kagawa University / 香川大学 | | 2562 | 2721 | 1419 | 1289 |
| 67 | 1419 | Toho University / 東邦大学 | | 3677 | 2781 | 1835 | 1132 |
| 68 | 1423 | Chuo University / 中央大学 | | 2429 | 1618 | 1788 | 1772 |
| 69 | 1440 | Shimane University / 島根大学 | | 1104 | 2933 | 1165 | 1492 |
| 70 | 1440 | Tottori University / 鳥取大学 | | 1745 | 2974 | 1682 | 1286 |
| 71 | 1443 | Toyohashi University of Technology / 豊橋科学技術大学 | | 3849 | 2043 | 1535 | 1530 |
| 72 | 1497 | Iwate University / 岩手大学 | | 1538 | 2152 | 2077 | 1689 |
| 73 | 1500 | University of Fukui / 福井大学 | | 2470 | 3219 | 1150 | 1377 |
| 74 | 1522 | Teikyo University / 帝京大学 | | 3217 | 3265 | 2482 | 1077 |
| 75 | 1527 | Jichi Medical School / 自治医科大学 | | 4835 | 4036 | 1040 | 1053 |
| 76 | 1532 | Rikkyo University / 立教大学 | | 1914 | 1703 | 3345 | 1747 |
| 77 | 1543 | University of Aizu / 会津大学 | | 1887 | 2551 | 1433 | 1715 |
| 78 | 1561 | Aoyama Gakuin University / 青山学院大学 | | 2986 | 2168 | 1492 | 1827 |
| 79 | 1564 | Sophia University / 上智大学 | | 2323 | 1959 | 1365 | 2036 |
| 80 | 1567 | Nagoya City University / 名古屋市立大学 | | 3899 | 3762 | 1353 | 1184 |
| 81 | 1598 | Hamamatsu University School of Medicine / 浜松医科大学 | | 4487 | 2837 | 1760 | 1427 |
| 82 | 1621 | Nippon Medical School / 日本医科大学 | | 6913 | 3312 | 1670 | 1227 |
| 83 | 1629 | Ibaraki University / 茨城大学 | | 1622 | 2939 | 1753 | 1695 |
| 84 | 1638 | Toyo University / 東洋大学 | | 3869 | 1528 | 1916 | 2188 |
| 85 | 1653 | Fujita Health University / 藤田保健衛生大学 | | 3962 | 3907 | 1363 | 1312 |
| 86 | 1667 | Kyoto Institute of Technology / 京都工芸繊維大学 | | 5051 | 2644 | 1775 | 1628 |
| 87 | 1669 | Kwansei Gakuin University / 関西学院大学 | | 1632 | 2358 | 1783 | 2036 |
| 88 | 1677 | Akita University / 秋田大学 | | 2793 | 2811 | 2124 | 1659 |
| 89 | 1685 | Ochanomizu University / お茶の水女子大学 | | 1354 | 2928 | 1622 | 1901 |
| 90 | 1688 | Kanagawa University / 神奈川大学 | | 2028 | 2505 | 2352 | 1854 |
| 91 | 1702 | Jikei University School of Medicine / 東京慈恵会医科大学 | | 2107 | 4532 | 1876 | 1239 |
| 92 | 1723 | Chubu University / 中部大学 | | 4161 | 3213 | 1099 | 1760 |
| 93 | 1734 | Kyoto Sangyo University / 京都産業大学 | | 3009 | 2377 | 1626 | 2092 |
| 94 | 1741 | Tokyo Medical University / 東京医科大学 | | 6393 | 3778 | 2609 | 1184 |
| 95 | 1742 | University of Hyogo (Himeji Institute of Technology) / 兵庫県立大学 | | 5789 | 4053 | 947 | 1484 |
| 96 | 1763 | Fukushima Medical University / 福島県立医科大学 | | 3964 | 3047 | 2831 | 1562 |
| 97 | 1779 | The Graduate University for Advanced Studies / 総合研究大学院大学 | | 5606 | 6107 | 1289 | 947 |
| 98 | 1804 | Hitotsubashi University / 一橋大学 | | 1415 | 1738 | 2338 | 2603 |
| 99 | 1813 | Shiga University of Medical Science / 滋賀医科大学 | | 3992 | 4218 | 2090 | 1360 |
| 100 | 1841 | Utsunomiya University / 宇都宮大学 | | 1705 | 3481 | 1743 | 1940 |
