| 1 | 65 | University of Tokyo / 東京大学 |  | 96 | 215 | 54 |
| 2 | 102 | Kyoto University / 京都大学 | | 143 | 145 | 148 |
| 3 | 216 | Osaka University / 大阪大学 | | 287 | 196 | 232 |
| 4 | 226 | Tohoku University / 東北大学 | | 324 | 182 | 235 |
| 5 | 299 | Nagoya University / 名古屋大学 | | 416 | 245 | 304 |
| 6 | 304 | Hokkaido University / 北海道大学 | | 319 | 328 | 375 |
| 7 | 316 | Kyushu University / 九州大学 | | 453 | 358 | 307 |
| 8 | 349 | Keio University / 慶応義塾大学 | | 225 | 788 | 490 |
| 9 | 361 | University of Tsukuba / 筑波大学 | | 389 | 453 | 438 |
| 10 | 371 | Tokyo Institute of Technology / 東京工業大学 | | 509 | 316 | 417 |
| 11 | 476 | Waseda University / 早稲田大学 | | 469 | 588 | 643 |
| 12 | 481 | Hiroshima University / 広島大学 | | 543 | 558 | 612 |
| 13 | 501 | Kobe University / 神戸大学 | | 624 | 581 | 596 |
| 14 | 684 | Okayama University / 岡山大学 | | 1125 | 696 | 707 |
| 15 | 789 | Kanazawa University / 金沢大学 | | 1088 | 1140 | 892 |
| 16 | 825 | Kumamoto University / 熊本大学 | | 1152 | 1074 | 953 |
| 17 | 900 | Ritsumeikan University / 立命館大学 | | 630 | 1144 | 1505 |
| 18 | 928 | Nihon University / 日本大学 | | 1021 | 1119 | 1234 |
| 19 | 940 | Shinshu University / 信州大学 | | 1623 | 1061 | 956 |
| 20 | 945 | Juntendo University / 順天堂大学 | | 1561 | 1121 | 999 |
| 21 | 979 | Tokyo Medical and Dental University / 東京医科歯科大学 | | 2069 | 1098 | 885 |
| 22 | 1004 | Niigata University / 新潟大学 | | 1296 | 1290 | 1221 |
| 23 | 1011 | Nagasaki University / 長崎大学 | | 1488 | 1378 | 1114 |
| 24 | 1016 | Tokyo University of Science / 東京理科大学 | | 1551 | 1086 | 1167 |
| 25 | 1021 | Kindai University (Kinki University) / 近畿大学 | | 1796 | 834 | 1147 |
| 26 | 1099 | Tokyo Metropolitan University / 首都大学東京 | | 2038 | 1093 | 1139 |
| 27 | 1135 | Mie University / 三重大学 | | 1150 | 1403 | 1614 |
| 28 | 1146 | Osaka City University / 大阪市立大学 | | 1313 | 2568 | 1279 |
| 29 | 1165 | Gifu University / 岐阜大学 | | 1773 | 1389 | 1312 |
| 30 | 1186 | Tottori University / 鳥取大学 | | 852 | 2140 | 1832 |
| 31 | 1215 | Ehime University / 愛媛大学 | | 1754 | 1490 | 1444 |
| 32 | 1215 | Japan Advanced Institute of Science & Technology / 北陸先端科学技術大学院大学 | | 726 | 1560 | 2214 |
| 33 | 1226 | Okinawa Institute of Science & Technology Graduate University / 沖縄科学技術大学院大学 | | 1851 | 933 | 1571 |
| 34 | 1227 | Nara Institute of Science & Technology / 奈良先端科学技術大学院大学 | | 1876 | 1206 | 1481 |
| 35 | 1232 | Tokai University / 東海大学 | | 1476 | 3314 | 1247 |
| 36 | 1238 | Yamagata University / 山形大学 | | 1300 | 1805 | 1665 |
| 37 | 1255 | Tokyo University of Agriculture and Technology / 東京農工大学 | | 2163 | 1051 | 1455 |
| 38 | 1265 | Gunma University / 群馬大学 | | 1873 | 1327 | 1536 |
| 39 | 1270 | Kagoshima University / 鹿児島大学 | | 1738 | 1928 | 1474 |
| 40 | 1294 | University of Toyama / 富山大学 | | 2275 | 1649 | 1358 |
| 41 | 1296 | United Nations University / 国際連合大学 | | 340 | 1795 | 3069 |
| 42 | 1296 | University of Tokushima / 徳島大学 | | 2301 | 1474 | 1384 |
| 43 | 1308 | Yokohama National University / 横浜国立大学 | | 1659 | 1032 | 1841 |
| 44 | 1312 | University of Electro-Communications / 電気通信大学 | | 1621 | 1372 | 1772 |
| 45 | 1330 | Osaka Prefecture University / 大阪府立大学 | | 1642 | 1878 | 1689 |
| 46 | 1333 | Yamaguchi University / 山口大学 | | 1606 | 2365 | 1616 |
| 47 | 1403 | Hirosaki University / 弘前大学 | | 1695 | 2510 | 1682 |
| 48 | 1410 | Kitasato University / 北里大学 | | 2122 | 2366 | 1543 |
| 49 | 1428 | Rikkyo University / 立教大学 | | 777 | 2708 | 2472 |
| 50 | 1437 | Chiba University / 千葉大学 | | 1361 | 6547 | 719 |
| 51 | 1437 | Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学 | | 2138 | 2080 | 1619 |
| 52 | 1477 | University of Ryukyus / 琉球大学 | | 2033 | 1859 | 1832 |
| 53 | 1481 | University of Yamanashi / 山梨大学 | | 2357 | 1644 | 1739 |
| 54 | 1513 | Tokyo Women's Medical University / 東京女子医科大学 | | 3202 | 2440 | 1358 |
| 55 | 1533 | Teikyo University / 帝京大学 | | 2515 | 3029 | 1479 |
| 56 | 1547 | Nagoya City University / 名古屋市立大学 | | 2815 | 2075 | 1596 |
| 57 | 1558 | Hosei University / 法政大学 | | 1213 | 2390 | 2449 |
| 58 | 1567 | Toho University / 東邦大学 | | 2025 | 4353 | 1468 |
| 59 | 1577 | Meiji University / 明治大学 | | 1090 | 2260 | 2621 |
| 60 | 1596 | Fukuoka University / 福岡大学 | | 2461 | 2517 | 1732 |
| 61 | 1644 | Nagoya Institute of Technology / 名古屋工業大学 | | 2351 | 1594 | 2091 |
| 62 | 1655 | Saga University / 佐賀大学 | | 2318 | 2560 | 1889 |
| 63 | 1664 | Kochi University / 高知大学 | | 1935 | 2663 | 2082 |
| 64 | 1677 | Kyoto Prefectural University of Medicine / 京都府立医科大学 | | 3958 | 2599 | 1386 |
| 65 | 1682 | Tokyo Medical University / 東京医科大学 | | 2728 | 4378 | 1389 |
| 66 | 1685 | Doshisha University / 同志社大学 | | 1209 | 2226 | 2762 |
| 67 | 1691 | Shimane University / 島根大学 | | 2930 | 1973 | 1852 |
| 68 | 1698 | Kagawa University / 香川大学 | | 2464 | 2888 | 1852 |
| 69 | 1702 | Nippon Medical School / 日本医科大学 | | 4008 | 2421 | 1460 |
| 70 | 1715 | Saitama University / 埼玉大学 | | 2548 | 1931 | 2067 |
| 71 | 1772 | Chuo University / 中央大学 | | 1705 | 1561 | 2745 |
| 72 | 1862 | Kwansei Gakuin University / 関西学院大学 | | 1885 | 2079 | 2688 |
| 73 | 1873 | University of Miyazaki / 宮崎大学 | | 2633 | 2720 | 2152 |
| 74 | 1877 | Sophia University / 上智大学 | | 1345 | 2827 | 2909 |
| 75 | 1904 | Kansai University / 関西大学 | | 1486 | 2054 | 3041 |
| 76 | 1933 | University of Fukui / 福井大学 | | 2366 | 2487 | 2489 |
| 77 | 1939 | University of Aizu / 会津大学 | | 2688 | 2509 | 2337 |
| 78 | 1940 | Shibaura Institute of Technology / 芝浦工業大学 | | 2769 | 2010 | 2437 |
| 79 | 1958 | Nagaoka University of Technology / 長岡技術科学大学 | | 2246 | 3130 | 2449 |
| 80 | 1961 | Ochanomizu University / お茶の水女子大学 | | 2476 | 3829 | 2152 |
| 81 | 1969 | The Graduate University for Advanced Studies / 総合研究大学院大学 | | 2286 | 6547 | 1094 |
| 82 | 1976 | Fukushima Medical University / 福島県立医科大学 | | 4732 | 3018 | 1623 |
| 83 | 1998 | Yokohama City University / 横浜市立大学 | | 959 | 2131 | 3748 |
| 84 | 2034 | Chubu University / 中部大学 | | 2047 | 3452 | 2661 |
| 85 | 2076 | University of Shizuoka / 静岡県立大学 | | 4349 | 4759 | 1527 |
| 86 | 2085 | Toyohashi University of Technology / 豊橋科学技術大学 | | 2511 | 3411 | 2524 |
| 87 | 2105 | Akita University / 秋田大学 | | 3093 | 3277 | 2372 |
| 88 | 2124 | International University of Health and Welfare / 国際医療福祉大学 | | 4132 | 3126 | 2086 |
| 89 | 2149 | Hamamatsu University School of Medicine / 浜松医科大学 | | 5340 | 2337 | 1962 |
| 90 | 2183 | Kyoto Institute of Technology / 京都工芸繊維大学 | | 2822 | 2490 | 2810 |
| 91 | 2210 | Aoyama Gakuin University / 青山学院大学 | | 2116 | 3001 | 3101 |
| 92 | 2232 | Ibaraki University / 茨城大学 | | 3162 | 2618 | 2735 |
| 93 | 2253 | Ryukoku University / 龍谷大学 | | 1863 | 3250 | 3278 |
| 94 | 2290 | Oita University / 大分大学 | | 3243 | 4268 | 2384 |
| 95 | 2312 | University of Hyogo (Himeji Institute of Technology) / 兵庫県立大学 | | 3949 | 1966 | 2751 |
| 96 | 2330 | Kurume University / 久留米大学 | | 4879 | 4838 | 1744 |
| 97 | 2360 | Saitama Medical University / 埼玉医科大学 | | 5267 | 5563 | 1474 |
| 98 | 2381 | Hitotsubashi University / 一橋大学 | | 1759 | 2271 | 3851 |
| 99 | 2389 | Iwate University / 岩手大学 | | 2183 | 4655 | 2924 |
| 100 | 2458 | Kansai Medical University / 関西医科大学 | | 4369 | 4601 | 2197 |
