| 1 | 66 | University of Tokyo / 東京大学 |  | 96 | 215 | 55 |
| 2 | 103 | Kyoto University / 京都大学 | | 143 | 145 | 150 |
| 3 | 218 | Osaka University / 大阪大学 | | 287 | 196 | 235 |
| 4 | 228 | Tohoku University / 東北大学 | | 324 | 182 | 238 |
| 5 | 301 | Nagoya University / 名古屋大学 | | 416 | 245 | 308 |
| 6 | 306 | Hokkaido University / 北海道大学 | | 319 | 328 | 380 |
| 7 | 318 | Kyushu University / 九州大学 | | 453 | 358 | 311 |
| 8 | 353 | Keio University / 慶応義塾大学 | | 225 | 789 | 496 |
| 9 | 365 | University of Tsukuba / 筑波大学 | | 389 | 453 | 443 |
| 10 | 376 | Tokyo Institute of Technology / 東京工業大学 | | 509 | 316 | 422 |
| 11 | 482 | Waseda University / 早稲田大学 | | 469 | 588 | 651 |
| 12 | 487 | Hiroshima University / 広島大学 | | 543 | 558 | 621 |
| 13 | 507 | Kobe University / 神戸大学 | | 624 | 581 | 604 |
| 14 | 692 | Okayama University / 岡山大学 | | 1124 | 696 | 716 |
| 15 | 798 | Kanazawa University / 金沢大学 | | 1087 | 1142 | 903 |
| 16 | 834 | Kumamoto University / 熊本大学 | | 1151 | 1075 | 965 |
| 17 | 859 | Yokohama City University / 横浜市立大学 | | 958 | 2135 | 921 |
| 18 | 911 | Ritsumeikan University / 立命館大学 | | 630 | 1146 | 1523 |
| 19 | 940 | Nihon University / 日本大学 | | 1020 | 1120 | 1247 |
| 20 | 952 | Shinshu University / 信州大学 | | 1622 | 1062 | 968 |
| 21 | 957 | Juntendo University / 順天堂大学 | | 1560 | 1122 | 1011 |
| 22 | 991 | Tokyo Medical and Dental University / 東京医科歯科大学 | | 2068 | 1099 | 896 |
| 23 | 1016 | Niigata University / 新潟大学 | | 1295 | 1292 | 1234 |
| 24 | 1023 | Nagasaki University / 長崎大学 | | 1487 | 1381 | 1126 |
| 25 | 1027 | Tokyo University of Science / 東京理科大学 | | 1550 | 1087 | 1180 |
| 26 | 1032 | Kindai University (Kinki University) / 近畿大学 | | 1795 | 835 | 1159 |
| 27 | 1111 | Tokyo Metropolitan University / 首都大学東京 | | 2037 | 1094 | 1151 |
| 28 | 1149 | Mie University / 三重大学 | | 1149 | 1406 | 1633 |
| 29 | 1160 | Osaka City University / 大阪市立大学 | | 1312 | 2574 | 1293 |
| 30 | 1179 | Gifu University / 岐阜大学 | | 1772 | 1392 | 1326 |
| 31 | 1200 | Tottori University / 鳥取大学 | | 851 | 2144 | 1853 |
| 32 | 1230 | Ehime University / 愛媛大学 | | 1753 | 1493 | 1461 |
| 33 | 1230 | Japan Advanced Institute of Science & Technology / 北陸先端科学技術大学院大学 | | 726 | 1563 | 2239 |
| 34 | 1241 | Okinawa Institute of Science & Technology Graduate University / 沖縄科学技術大学院大学 | | 1850 | 934 | 1590 |
| 35 | 1242 | Nara Institute of Science & Technology / 奈良先端科学技術大学院大学 | | 1875 | 1208 | 1499 |
| 36 | 1247 | Tokai University / 東海大学 | | 1475 | 3320 | 1261 |
| 37 | 1253 | Yamagata University / 山形大学 | | 1299 | 1808 | 1685 |
| 38 | 1270 | Tokyo University of Agriculture and Technology / 東京農工大学 | | 2162 | 1052 | 1472 |
| 39 | 1280 | Gunma University / 群馬大学 | | 1872 | 1329 | 1554 |
| 40 | 1284 | Kagoshima University / 鹿児島大学 | | 1737 | 1932 | 1492 |
| 41 | 1309 | University of Toyama / 富山大学 | | 2274 | 1652 | 1374 |
| 42 | 1311 | United Nations University / 国際連合大学 | | 340 | 1798 | 3096 |
| 43 | 1311 | University of Tokushima / 徳島大学 | | 2300 | 1477 | 1400 |
| 44 | 1324 | Yokohama National University / 横浜国立大学 | | 1658 | 1033 | 1862 |
| 45 | 1328 | University of Electro-Communications / 電気通信大学 | | 1620 | 1375 | 1793 |
| 46 | 1347 | Osaka Prefecture University / 大阪府立大学 | | 1641 | 1881 | 1710 |
| 47 | 1350 | Yamaguchi University / 山口大学 | | 1605 | 2369 | 1635 |
| 48 | 1420 | Hirosaki University / 弘前大学 | | 1694 | 2516 | 1703 |
| 49 | 1427 | Kitasato University / 北里大学 | | 2121 | 2370 | 1561 |
| 50 | 1445 | Rikkyo University / 立教大学 | | 777 | 2714 | 2496 |
| 51 | 1454 | Chiba University / 千葉大学 | | 1360 | 6553 | 729 |
| 52 | 1454 | Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学 | | 2137 | 2084 | 1638 |
| 53 | 1494 | University of Ryukyus / 琉球大学 | | 2032 | 1862 | 1853 |
| 54 | 1498 | University of Yamanashi / 山梨大学 | | 2356 | 1647 | 1759 |
| 55 | 1502 | Fujita Health University / 藤田保健衛生大学 | | 2654 | 1964 | 1571 |
| 56 | 1508 | Jichi Medical School / 自治医科大学 | | 2776 | 2978 | 1357 |
| 57 | 1532 | Tokyo Women's Medical University / 東京女子医科大学 | | 3201 | 2444 | 1374 |
| 58 | 1552 | Teikyo University / 帝京大学 | | 2514 | 3035 | 1497 |
| 59 | 1566 | Nagoya City University / 名古屋市立大学 | | 2814 | 2079 | 1615 |
| 60 | 1577 | Hosei University / 法政大学 | | 1212 | 2394 | 2473 |
| 61 | 1586 | Toho University / 東邦大学 | | 2024 | 4359 | 1486 |
| 62 | 1596 | Meiji University / 明治大学 | | 1089 | 2264 | 2647 |
| 63 | 1615 | Fukuoka University / 福岡大学 | | 2460 | 2523 | 1752 |
| 64 | 1619 | Jikei University School of Medicine / 東京慈恵会医科大学 | | 2829 | 3245 | 1481 |
| 65 | 1664 | Showa University / 昭和大学 | | 2805 | 2541 | 1685 |
| 66 | 1664 | Nagoya Institute of Technology / 名古屋工業大学 | | 2350 | 1597 | 2112 |
| 67 | 1676 | Saga University / 佐賀大学 | | 2317 | 2566 | 1910 |
| 68 | 1685 | Kochi University / 高知大学 | | 1934 | 2669 | 2103 |
| 69 | 1699 | Kyoto Prefectural University of Medicine / 京都府立医科大学 | | 3957 | 2605 | 1402 |
| 70 | 1704 | Tokyo Medical University / 東京医科大学 | | 2727 | 4384 | 1405 |
| 71 | 1707 | Doshisha University / 同志社大学 | | 1208 | 2230 | 2788 |
| 72 | 1713 | Shimane University / 島根大学 | | 2929 | 1977 | 1873 |
| 73 | 1719 | Kagawa University / 香川大学 | | 2463 | 2894 | 1873 |
| 74 | 1723 | Nippon Medical School / 日本医科大学 | | 4007 | 2425 | 1477 |
| 75 | 1735 | Saitama University / 埼玉大学 | | 2547 | 1935 | 2088 |
| 76 | 1790 | Chuo University / 中央大学 | | 1704 | 1564 | 2771 |
| 77 | 1881 | Kwansei Gakuin University / 関西学院大学 | | 1884 | 2083 | 2714 |
| 78 | 1892 | University of Miyazaki / 宮崎大学 | | 2632 | 2726 | 2174 |
| 79 | 1896 | Sophia University / 上智大学 | | 1344 | 2833 | 2935 |
| 80 | 1922 | Kansai University / 関西大学 | | 1485 | 2058 | 3068 |
| 81 | 1951 | University of Fukui / 福井大学 | | 2365 | 2492 | 2513 |
| 82 | 1957 | University of Aizu / 会津大学 | | 2687 | 2515 | 2361 |
| 83 | 1958 | Shibaura Institute of Technology / 芝浦工業大学 | | 2768 | 2014 | 2461 |
| 84 | 1976 | Nagaoka University of Technology / 長岡技術科学大学 | | 2245 | 3136 | 2473 |
| 85 | 1979 | Ochanomizu University / お茶の水女子大学 | | 2475 | 3835 | 2174 |
| 86 | 1987 | The Graduate University for Advanced Studies / 総合研究大学院大学 | | 2285 | 6553 | 1106 |
| 87 | 1994 | Fukushima Medical University / 福島県立医科大学 | | 4731 | 3024 | 1643 |
| 88 | 2051 | Chubu University / 中部大学 | | 2046 | 3458 | 2687 |
| 89 | 2093 | University of Shizuoka / 静岡県立大学 | | 4348 | 4765 | 1545 |
| 90 | 2102 | Toyohashi University of Technology / 豊橋科学技術大学 | | 2510 | 3417 | 2549 |
| 91 | 2122 | Akita University / 秋田大学 | | 3092 | 3283 | 2396 |
| 92 | 2141 | International University of Health and Welfare / 国際医療福祉大学 | | 4131 | 3132 | 2107 |
| 93 | 2166 | Hamamatsu University School of Medicine / 浜松医科大学 | | 5338 | 2341 | 1983 |
| 94 | 2199 | Kyoto Institute of Technology / 京都工芸繊維大学 | | 2821 | 2495 | 2836 |
| 95 | 2226 | Aoyama Gakuin University / 青山学院大学 | | 2115 | 3007 | 3128 |
| 96 | 2248 | Ibaraki University / 茨城大学 | | 3161 | 2624 | 2761 |
| 97 | 2270 | Ryukoku University / 龍谷大学 | | 1862 | 3256 | 3305 |
| 98 | 2308 | Oita University / 大分大学 | | 3242 | 4274 | 2408 |
| 99 | 2329 | University of Hyogo (Himeji Institute of Technology) / 兵庫県立大学 | | 3948 | 1970 | 2777 |
| 100 | 2347 | Kurume University / 久留米大学 | | 4878 | 4844 | 1764 |
