| 1 | 65 | University of Tokyo / 東京大学 |  | 172 | 96 | 318 | 41 |
| 2 | 102 | Kyoto University / 京都大学 | | 220 | 145 | 232 | 87 |
| 3 | 172 | Osaka University / 大阪大学 | | 66 | 307 | 149 | 146 |
| 4 | 235 | Tohoku University / 東北大学 | | 574 | 375 | 343 | 163 |
| 5 | 254 | Nagoya University / 名古屋大学 | | 950 | 365 | 139 | 228 |
| 6 | 296 | Kyushu University / 九州大学 | | 662 | 413 | 391 | 243 |
| 7 | 301 | Hokkaido University / 北海道大学 | | 466 | 370 | 262 | 316 |
| 8 | 308 | Tokyo Institute of Technology / 東京工業大学 | | 634 | 477 | 95 | 286 |
| 9 | 314 | Keio University / 慶応義塾大学 | | 581 | 219 | 673 | 402 |
| 10 | 346 | University of Tsukuba / 筑波大学 | | 744 | 369 | 483 | 366 |
| 11 | 447 | Hiroshima University / 広島大学 | | 652 | 528 | 706 | 484 |
| 12 | 454 | Waseda University / 早稲田大学 | | 1027 | 543 | 420 | 519 |
| 13 | 465 | Kobe University / 神戸大学 | | 782 | 606 | 671 | 471 |
| 14 | 632 | Okayama University / 岡山大学 | | 909 | 1133 | 569 | 547 |
| 15 | 690 | Ritsumeikan University / 立命館大学 | | 957 | 541 | 1082 | 956 |
| 16 | 761 | Chiba University / 千葉大学 | | 3284 | 1199 | 1820 | 552 |
| 17 | 782 | Nihon University / 日本大学 | | 126 | 879 | 1197 | 991 |
| 18 | 784 | Kanazawa University / 金沢大学 | | 1678 | 1289 | 704 | 741 |
| 19 | 790 | Shinshu University / 信州大学 | | 1715 | 1420 | 714 | 697 |
| 20 | 798 | Tokyo University of Science / 東京理科大学 | | 2134 | 1119 | 707 | 840 |
| 21 | 841 | Kumamoto University / 熊本大学 | | 1715 | 1447 | 951 | 782 |
| 22 | 851 | Niigata University / 新潟大学 | | 1471 | 1397 | 827 | 859 |
| 23 | 882 | Tokyo Medical and Dental University / 東京医科歯科大学 | | 3187 | 2001 | 596 | 718 |
| 24 | 905 | Nagasaki University / 長崎大学 | | 1623 | 1368 | 954 | 921 |
| 25 | 910 | Kindai University (Kinki University) / 近畿大学 | | 2082 | 1527 | 757 | 891 |
| 26 | 918 | Tokyo Metropolitan University / 首都大学東京 | | 2902 | 2100 | 428 | 793 |
| 27 | 984 | Osaka City University / 大阪市立大学 | | 1881 | 1597 | 1078 | 953 |
| 28 | 1008 | Tokai University / 東海大学 | | 2261 | 1249 | 2075 | 1015 |
| 29 | 1022 | Yamagata University / 山形大学 | | 1830 | 1319 | 1642 | 1069 |
| 30 | 1041 | Tokyo University of Agriculture and Technology / 東京農工大学 | | 3161 | 1798 | 601 | 1035 |
| 31 | 1050 | Ehime University / 愛媛大学 | | 2281 | 1511 | 1038 | 1097 |
| 32 | 1055 | Yamaguchi University / 山口大学 | | 1724 | 1195 | 1994 | 1151 |
| 33 | 1065 | Kagoshima University / 鹿児島大学 | | 1820 | 1494 | 1621 | 1055 |
| 34 | 1066 | Gifu University / 岐阜大学 | | 1920 | 1649 | 1059 | 1082 |
| 35 | 1074 | Gunma University / 群馬大学 | | 2261 | 1377 | 1525 | 1133 |
| 36 | 1074 | University of Tokushima / 徳島大学 | | 1802 | 1947 | 817 | 1028 |
| 37 | 1078 | Mie University / 三重大学 | | 2139 | 1373 | 1102 | 1234 |
| 38 | 1119 | University of Toyama / 富山大学 | | 2186 | 1786 | 928 | 1138 |
| 39 | 1122 | Shizuoka University / 静岡大学 | | 2147 | 1764 | 1124 | 1115 |
| 40 | 1128 | Juntendo University / 順天堂大学 | | 4137 | 2778 | 631 | 886 |
| 41 | 1129 | Nara Institute of Science & Technology / 奈良先端科学技術大学院大学 | | 1480 | 1931 | 697 | 1211 |
| 42 | 1132 | Osaka Prefecture University / 大阪府立大学 | | 1915 | 1940 | 993 | 1113 |
| 43 | 1162 | University of Electro-Communications / 電気通信大学 | | 2021 | 1342 | 1659 | 1344 |
| 44 | 1168 | Japan Advanced Institute of Science & Technology / 北陸先端科学技術大学院大学 | | 2124 | 1038 | 1192 | 1662 |
| 45 | 1174 | Yokohama National University / 横浜国立大学 | | 2421 | 1632 | 739 | 1376 |
| 46 | 1178 | Yokohama City University / 横浜市立大学 | | 4413 | 2767 | 1089 | 871 |
| 47 | 1185 | Tokyo Women's Medical University / 東京女子医科大学 | | 5715 | 2407 | 1028 | 949 |
| 48 | 1218 | United Nations University (国際連合大学) | | 1815 | 326 | 973 | 2815 |
| 49 | 1225 | Toho University / 東邦大学 | | 3691 | 1683 | 1785 | 1192 |
| 50 | 1231 | Doshisha University / 同志社大学 | | 1319 | 1151 | 795 | 1815 |
| 51 | 1235 | Meiji University / 明治大学 | | 1378 | 970 | 1461 | 1836 |
| 52 | 1268 | Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学 | | 2773 | 1729 | 1237 | 1382 |
| 53 | 1288 | Kitasato University / 北里大学 | | 3563 | 2230 | 1691 | 1115 |
| 54 | 1311 | Nagoya Institute of Technology / 名古屋工業大学 | | 2821 | 1939 | 1202 | 1385 |
| 55 | 1330 | University of Ryukyus / 琉球大学 | | 1355 | 1674 | 1490 | 1530 |
| 56 | 1334 | Saga University / 佐賀大学 | | 2804 | 2057 | 1591 | 1291 |
| 57 | 1338 | Fukuoka University / 福岡大学 | | 2902 | 1795 | 1566 | 1407 |
| 58 | 1338 | University of Yamanashi / 山梨大学 | | 2844 | 2310 | 1097 | 1299 |
| 59 | 1370 | Saitama University / 埼玉大学 | | 3196 | 1878 | 1147 | 1498 |
| 60 | 1381 | Hosei University / 法政大学 | | 1185 | 1168 | 1578 | 1982 |
| 61 | 1388 | Kagawa University / 香川大学 | | 2134 | 2473 | 1414 | 1319 |
| 62 | 1445 | Hirosaki University / 弘前大学 | | 2541 | 2078 | 1855 | 1458 |
| 63 | 1459 | Jichi Medical School / 自治医科大学 | | 4446 | 3550 | 1215 | 1088 |
| 64 | 1461 | Kochi University / 高知大学 | | 2889 | 2421 | 2604 | 1273 |
| 65 | 1467 | Nippon Medical School / 日本医科大学 | | 7205 | 3094 | 1112 | 1214 |
| 66 | 1469 | Kansai University / 関西大学 | | 1510 | 1563 | 1330 | 1933 |
| 67 | 1477 | Nagoya City University / 名古屋市立大学 | | 2533 | 3157 | 1233 | 1303 |
| 68 | 1486 | Tottori University / 鳥取大学 | | 2318 | 2578 | 1680 | 1412 |
| 69 | 1490 | Teikyo University / 帝京大学 | | 4316 | 2792 | 3141 | 1120 |
| 70 | 1496 | Nagaoka University of Technology / 長岡技術科学大学 | | 2487 | 1891 | 1186 | 1815 |
| 71 | 1499 | Tokyo Medical University / 東京医科大学 | | 4729 | 3023 | 1951 | 1193 |
| 72 | 1511 | Shimane University / 島根大学 | | 2153 | 2592 | 1392 | 1507 |
| 73 | 1514 | Ochanomizu University / お茶の水女子大学 | | 2729 | 2435 | 1707 | 1493 |
| 74 | 1526 | Chuo University / 中央大学 | | 1678 | 1491 | 2155 | 1947 |
| 75 | 1543 | University of Miyazaki / 宮崎大学 | | 1669 | 2573 | 1388 | 1620 |
| 76 | 1569 | Rikkyo University / 立教大学 | | 2106 | 1788 | 1814 | 1914 |
| 77 | 1579 | Okinawa Institute of Science & Technology Graduate University / 沖縄科学技術大学院大学 | | 3335 | 2853 | 846 | 1655 |
| 78 | 1618 | Showa University / 昭和大学 | | 4953 | 3184 | 1887 | 1371 |
| 79 | 1618 | Fujita Health University / 藤田保健衛生大学 | | 5241 | 3541 | 1013 | 1413 |
| 80 | 1647 | Jikei University School of Medicine / 東京慈恵会医科大学 | | 7205 | 3840 | 1631 | 1231 |
| 81 | 1669 | Kyoto Prefectural University of Medicine / 京都府立医科大学 | | 4769 | 4032 | 1869 | 1211 |
| 82 | 1676 | Toyohashi University of Technology / 豊橋科学技術大学 | | 3656 | 2130 | 1945 | 1857 |
| 83 | 1688 | University of Aizu / 会津大学 | | 4108 | 2486 | 1765 | 1755 |
| 84 | 1693 | (1) Hiroshima Institute of Technology / 広島工業大学 | | 5888 | 2364 | 6255 | 1231 |
| 85 | 1706 | Sophia University / 上智大学 | | 2719 | 1598 | 1773 | 2267 |
| 86 | 1708 | University of Fukui / 福井大学 | | 2762 | 3539 | 1247 | 1565 |
| 87 | 1709 | Aoyama Gakuin University / 青山学院大学 | | 3013 | 1863 | 1697 | 2125 |
| 88 | 1719 | Kurume University / 久留米大学 | | 4654 | 3776 | 2180 | 1337 |
| 89 | 1720 | The Graduate University for Advanced Studies / 総合研究大学院大学 | | 5369 | 5720 | 1397 | 997 |
| 90 | 1732 | Hamamatsu University School of Medicine / 浜松医科大学 | | 7169 | 3953 | 832 | 1503 |
| 91 | 1736 | University of Hyogo (Himeji Institute of Technology) / 兵庫県立大学 | | 3809 | 3584 | 1029 | 1635 |
| 92 | 1737 | Sapporo Medical University / 札幌医科大学 | | 5069 | 3551 | 2972 | 1334 |
| 93 | 1744 | Kwansei Gakuin University / 関西学院大学 | | 1248 | 2028 | 1864 | 2175 |
| 94 | 1764 | Akita University / 秋田大学 | | 2867 | 2602 | 2219 | 1842 |
| 95 | 1791 | Iwate University / 岩手大学 | | 2931 | 2203 | 2443 | 2016 |
| 96 | 1797 | Chubu University / 中部大学 | | 3428 | 3070 | 881 | 1973 |
| 97 | 1806 | Kyoto Sangyo University / 京都産業大学 | | 2954 | 2154 | 1798 | 2164 |
| 98 | 1815 | Ibaraki University / 茨城大学 | | 2691 | 2678 | 1957 | 1940 |
| 99 | 1837 | Kyoto Institute of Technology / 京都工芸繊維大学 | | 3855 | 2755 | 2150 | 1882 |
| 100 | 1849 | Saitama Medical University / 埼玉医科大学 | | 6784 | 4590 | 1750 | 1359 |
