| 1 | 69 | University of Tokyo / 東京大学 |  | 104 | 200 | 61 |
| 2 | 118 | Kyoto University / 京都大学 | | 152 | 153 | 168 |
| 3 | 243 | Osaka University / 大阪大学 | | 321 | 202 | 264 |
| 4 | 244 | Tohoku University / 東北大学 | | 347 | 193 | 248 |
| 5 | 309 | Nagoya University / 名古屋大学 | | 418 | 245 | 338 |
| 6 | 319 | Hokkaido University / 北海道大学 | | 348 | 351 | 415 |
| 7 | 334 | Kyushu University / 九州大学 | | 460 | 373 | 340 |
| 8 | 358 | Keio University / 慶応義塾大学 | | 250 | 821 | 512 |
| 9 | 373 | University of Tsukuba / 筑波大学 | | 412 | 485 | 475 |
| 10 | 387 | Tokyo Institute of Technology / 東京工業大学 | | 522 | 329 | 474 |
| 11 | 481 | Hiroshima University / 広島大学 | | 561 | 578 | 618 |
| 12 | 487 | Waseda University / 早稲田大学 | | 507 | 599 | 670 |
| 13 | 526 | Kobe University / 神戸大学 | | 636 | 598 | 670 |
| 14 | 724 | Okayama University / 岡山大学 | | 1118 | 710 | 796 |
| 15 | 835 | Kumamoto University / 熊本大学 | | 1098 | 1022 | 993 |
| 16 | 854 | United Nations University / 国際連合大学 | | 316 | 1639 | 1860 |
| 17 | 865 | Kanazawa University / 金沢大学 | | 1202 | 1082 | 982 |
| 18 | 895 | Ritsumeikan University / 立命館大学 | | 630 | 1176 | 1554 |
| 19 | 976 | Yokohama City University / 横浜市立大学 | | 1347 | 1923 | 1001 |
| 20 | 984 | Nihon University / 日本大学 | | 1032 | 1156 | 1366 |
| 21 | 991 | Shinshu University / 信州大学 | | 1552 | 1122 | 1072 |
| 22 | 994 | Tokyo Medical and Dental University / 東京医科歯科大学 | | 1964 | 1013 | 928 |
| 23 | 1024 | Nagasaki University / 長崎大学 | | 1396 | 1327 | 1173 |
| 24 | 1056 | Kindai University (Kinki University) / 近畿大学 | | 1728 | 842 | 1220 |
| 25 | 1086 | Tokyo University of Science / 東京理科大学 | | 1513 | 1101 | 1310 |
| 26 | 1091 | Niigata University / 新潟大学 | | 1376 | 1292 | 1335 |
| 27 | 1214 | Gifu University / 岐阜大学 | | 1747 | 1387 | 1408 |
| 28 | 1221 | Tokyo Metropolitan University / 首都大学東京 | | 2023 | 1114 | 1361 |
| 29 | 1229 | Tokai University / 東海大学 | | 1457 | 2775 | 1333 |
| 30 | 1241 | Okinawa Institute of Science & Technology Graduate University / 沖縄科学技術大学院大学 | | 1722 | 922 | 1616 |
| 31 | 1252 | Yamagata University / 山形大学 | | 1242 | 1751 | 1738 |
| 32 | 1258 | Mie University / 三重大学 | | 1307 | 1371 | 1801 |
| 33 | 1275 | Ehime University / 愛媛大学 | | 1709 | 1459 | 1582 |
| 34 | 1291 | Japan Advanced Institute of Science & Technology / 北陸先端科学技術大学院大学 | | 854 | 1586 | 2338 |
| 35 | 1298 | Tokyo University of Agriculture and Technology / 東京農工大学 | | 2012 | 1076 | 1578 |
| 36 | 1325 | Gunma University / 群馬大学 | | 1787 | 1367 | 1683 |
| 37 | 1338 | University of Electro-Communications / 電気通信大学 | | 1490 | 1432 | 1894 |
| 38 | 1343 | Kagoshima University / 鹿児島大学 | | 1753 | 1914 | 1615 |
| 39 | 1348 | Nara Institute of Science & Technology / 奈良先端科学技術大学院大学 | | 1945 | 1175 | 1708 |
| 40 | 1349 | University of Tokushima / 徳島大学 | | 2198 | 1468 | 1520 |
| 41 | 1353 | University of Toyama / 富山大学 | | 2210 | 1612 | 1489 |
| 42 | 1358 | Tottori University / 鳥取大学 | | 1199 | 2038 | 2008 |
| 43 | 1391 | Yokohama National University / 横浜国立大学 | | 1640 | 1030 | 2059 |
| 44 | 1394 | Yamaguchi University / 山口大学 | | 1681 | 2018 | 1763 |
| 45 | 1407 | Kitasato University / 北里大学 | | 2148 | 2063 | 1545 |
| 46 | 1470 | University of Ryukyus / 琉球大学 | | 1850 | 1734 | 1908 |
| 47 | 1482 | Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学 | | 2086 | 2118 | 1706 |
| 48 | 1494 | Hirosaki University / 弘前大学 | | 1826 | 2378 | 1828 |
| 49 | 1499 | Jichi Medical School / 自治医科大学 | | 2741 | 2561 | 1403 |
| 50 | 1512 | Rikkyo University / 立教大学 | | 924 | 2674 | 2573 |
| 51 | 1537 | Fujita Health University / 藤田保健衛生大学 | | 2720 | 1764 | 1606 |
| 52 | 1561 | Hosei University / 法政大学 | | 1235 | 2343 | 2401 |
| 53 | 1561 | Toho University / 東邦大学 | | 2116 | 3661 | 1559 |
| 54 | 1569 | Chiba University / 千葉大学 | | 1312 | 8183 | 815 |
| 55 | 1603 | Tokyo Women's Medical University / 東京女子医科大学 | | 3236 | 2136 | 1504 |
| 56 | 1610 | Nagoya City University / 名古屋市立大学 | | 2815 | 1820 | 1706 |
| 57 | 1610 | University of Yamanashi / 山梨大学 | | 2414 | 1563 | 1950 |
| 58 | 1615 | Tokyo Medical University / 東京医科大学 | | 2779 | 3571 | 1408 |
| 59 | 1637 | The Graduate University for Advanced Studies / 総合研究大学院大学 | | 2698 | 5404 | 1213 |
| 60 | 1640 | Jikei University School of Medicine / 東京慈恵会医科大学 | | 3046 | 2938 | 1500 |
| 61 | 1645 | Meiji University / 明治大学 | | 1067 | 2096 | 2818 |
| 62 | 1651 | Fukuoka University / 福岡大学 | | 2409 | 2453 | 1855 |
| 63 | 1662 | Teikyo University / 帝京大学 | | 2654 | 2764 | 1694 |
| 64 | 1693 | Saga University / 佐賀大学 | | 2276 | 2199 | 2041 |
| 65 | 1711 | Showa University / 昭和大学 | | 2955 | 2290 | 1785 |
| 66 | 1717 | Nippon Medical School / 日本医科大学 | | 3766 | 2130 | 1559 |
| 67 | 1722 | Kyoto Prefectural University of Medicine / 京都府立医科大学 | | 4074 | 2138 | 1492 |
| 68 | 1746 | Nagoya Institute of Technology / 名古屋工業大学 | | 2213 | 1594 | 2360 |
| 69 | 1754 | Kagawa University / 香川大学 | | 2722 | 2793 | 1885 |
| 70 | 1797 | Shimane University / 島根大学 | | 2950 | 1939 | 2021 |
| 71 | 1803 | Saitama University / 埼玉大学 | | 2361 | 1929 | 2304 |
| 72 | 1807 | Kochi University / 高知大学 | | 2082 | 2545 | 2323 |
| 73 | 1811 | Doshisha University / 同志社大学 | | 1258 | 2151 | 2995 |
| 74 | 1850 | Juntendo University / 順天堂大学 | | 1735 | 8183 | 1017 |
| 75 | 1891 | Chuo University / 中央大学 | | 1656 | 1546 | 3012 |
| 76 | 1933 | University of Miyazaki / 宮崎大学 | | 2727 | 2272 | 2323 |
| 77 | 1938 | Shibaura Institute of Technology / 芝浦工業大学 | | 2668 | 1875 | 2451 |
| 78 | 1949 | University of Aizu / 会津大学 | | 2484 | 2354 | 2459 |
| 79 | 1978 | Sophia University / 上智大学 | | 1223 | 2777 | 3281 |
| 80 | 2010 | Kwansei Gakuin University / 関西学院大学 | | 1998 | 1961 | 2941 |
| 81 | 2013 | Fukushima Medical University / 福島県立医科大学 | | 4701 | 2663 | 1751 |
| 82 | 2068 | University of Shizuoka / 静岡県立大学 | | 4506 | 3497 | 1738 |
| 83 | 2074 | University of Fukui / 福井大学 | | 2566 | 2333 | 2682 |
| 84 | 2079 | Nagaoka University of Technology / 長岡技術科学大学 | | 2227 | 2937 | 2728 |
| 85 | 2098 | Ochanomizu University / お茶の水女子大学 | | 2438 | 3600 | 2520 |
| 86 | 2102 | International University of Health and Welfare / 国際医療福祉大学 | | 4157 | 2340 | 2115 |
| 87 | 2114 | Kansai University / 関西大学 | | 1529 | 2017 | 3457 |
| 88 | 2128 | Toyohashi University of Technology / 豊橋科学技術大学 | | 2275 | 3426 | 2670 |
| 89 | 2141 | Akita University / 秋田大学 | | 3091 | 2964 | 2470 |
| 90 | 2174 | Saitama Medical University / 埼玉医科大学 | | 5265 | 4067 | 1600 |
| 91 | 2185 | Hamamatsu University School of Medicine / 浜松医科大学 | | 5118 | 2037 | 2062 |
| 92 | 2203 | Ryukoku University / 龍谷大学 | | 1726 | 2835 | 3329 |
| 93 | 2241 | Kurume University / 久留米大学 | | 4723 | 4079 | 1850 |
| 94 | 2257 | Chubu University / 中部大学 | | 2413 | 3256 | 2880 |
| 95 | 2301 | Ibaraki University / 茨城大学 | | 3027 | 2612 | 2871 |
| 96 | 2318 | Aoyama Gakuin University / 青山学院大学 | | 2183 | 2976 | 3217 |
| 97 | 2338 | Sapporo Medical University / 札幌医科大学 | | 3693 | 4125 | 2366 |
| 98 | 2340 | Hitotsubashi University / 一橋大学 | | 1714 | 2315 | 3734 |
| 99 | 2343 | Kyoto Institute of Technology / 京都工芸繊維大学 | | 2812 | 2267 | 3104 |
| 100 | 2345 | Oita University / 大分大学 | | 3344 | 3953 | 2550 |
